如何查Genebank已经公布的植物rbcL基因序列?然后如何通过这个设计一对引物呢?
学术期刊数据库中查找rbcL基因相关信息,然后找到里面一些物种的rbcL基因序列,用这些序列去GENEBANK中用BLAST这个页面比对一下,会根据与已知序列的相似程度比对出一些物种的rbcL基因序列,挑取你所需要的物种的序列,尽量多点,然后下下来,用DNAMAN或别的生物学分析工具进行比对,会比对出保守区序列,选取保守区序列进行引物设计,先扩增出这段序列,然后进行延伸,进行全基因扩增。
如何寻找不同植物的ADH基因在Genbank中的基因序列号?
在GeneBank 中查找基因序列只要输入accession号就可以了 ,在记录的末尾有各种记录的详细说明,如果你没有accession号,可以把你手头的编号用source等信息源转换成accession号
什么是位序列?
位序列是某些影响动物、真菌及植物发育的基因所拥有的一段DNA序列,拥有homeobox的基因称作homeobox基因,统称homeobox基因家族。 同源异形盒模体在进化中广泛存在。其重要意义是通过同源异形盒探针与很多真核的基因组进行杂交而获得。在蛙,小鼠和人的DNA都发现同源异形盒的存在。在蛙和哺乳动物基因在胚胎发生的早期表达增强了与果蝇一些基因的平行关系,表明可能这些会有同源异形的基因与各种生物胚胎发育中基因调节有关。 位序列之长度约180个核苷酸,能转录出一段蛋白质区块(protein domain),称为homeobox区块。 位序列重要意义是通过同源异形盒探针与很多真核的基因组进行杂交而获得。在蛙,小鼠和人的DNA都发现同源异形盒的存在。在蛙和哺乳动物基因在胚胎发生的早期表达增强了与果蝇一些基因的平行关系,表明可能这些会有同源异形的基因与各种生物胚胎发育中基因调节有关。
求常用的植物actin基因序列或引物,山茶科的更好(查了文献没查到),文献里的引物用括号括起来是什么?
通常actin基因用于基因表达定量的内参。 不同植物的actin序列不同,必须找到同种植物的actin序列做参考;可以在Genbank中查找;也可根据文献查找。其他的持家基因housekeeping基因都可以作为内参基因。引物序列中的括号内的序列为简并碱基,即在括号内的位置,存在两种碱基,如上述括号内的(G/T)。
actin引物是什么?
Actin引物是一种用于分子生物学实验中的引物,用于扩增和检测与肌动蛋白(actin)基因相关的DNA序列。它通常是一段具有特定序列的短DNA片段,能够与目标DNA序列的互补区域结合,并通过聚合酶链式反应(PCR)扩增目标序列。Actin引物在细胞生物学和遗传学研究中广泛应用,用于研究细胞骨架结构、细胞运动和细胞分裂等过程。
植物actin引物序列是用于PCR扩增植物中actin基因的引物序列。actin是一种重要的细胞骨架蛋白,在植物细胞中起着维持细胞形态和细胞运动的作用。